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研究方向

生命的分子機器 如果我們把復雜的生命活動(dòng)過(guò)程分解為一個(gè)個(gè)單獨的物理、化學(xué)過(guò)程，這些物理、化學(xué)過(guò)程依賴(lài)于細胞內各式各樣結構復雜而有序的分子機器來(lái)進(jìn)行，這些分子機器由蛋白質(zhì)、核酸、糖類(lèi)、脂類(lèi)等生物大分子或這些大分子的復合物構成的。正是依靠了生命體內微觀(guān)世界中眾多的分子機器的有序運轉、協(xié)同配合，生命體才有了活力。 構成生物大分子的原子主要是氫、碳、氮、氧、磷、硫以及少量的金屬原子，這些普通的原子一旦在三維空間中特定地排列，就使得這個(gè)生物大分子成為一個(gè)分子機器，能執行特定的生命功能。形象地說(shuō)，本課題組的研究方向就是要把細胞中重要的分子機器打開(kāi)來(lái)看一看，了解什么樣的結構導致這些分子機器具有特定的功能，這些功能又是如何精確地被其它外界因素調控的。通過(guò)研究結構與功能的關(guān)系來(lái)回答一些重要的生物學(xué)問(wèn)題。這些重要生物學(xué)問(wèn)題的回答一方面是充分認識生命現象本質(zhì)，掌握生命活動(dòng)規律所必須的，具有重大的科學(xué)和認識價(jià)值。另一方面，這些研究成果可以應用于社會(huì )生產(chǎn)，對人類(lèi)的經(jīng)濟生活產(chǎn)生重大影響。

新藥申請

在Syrrx公司（Syrrx公司于2005年2月7日為日本武田制藥公司收購成為武田-圣地亞哥分部）擔任科學(xué)家期間，作為基于結構的糖尿病藥物設計主要參與人之一，所設計的高選擇性雙肽蛋白酶?4抑制劑已通過(guò)臨床試驗。武田制藥于2008年1月7日向美國食品與藥物管理局（FDA）遞交2型糖尿病新藥申請(藥名alogliptin)，2010年6月27日美國食品與藥物管理局（FDA）以所提供數據不足為理由拒絕批準此新藥申請，武田制藥決定增補數據預期在兩年之內再次遞交此新藥申請；此外，武田制藥與2008年9月23日向美國食品與藥物管理局（FDA）遞交2型糖尿病復方藥新藥申請(藥名alogliptin/Actos)。 代表性論文 1. Kong C, Zeng W,Ye S, Chen L, Sauer D, Lam Y, Derebe M, Jiang Y (2012) Distinct Gating Mechanisms revealed by the structures of a multi-ligand gated Kchannel.eLIFE, doi: 10.7554/eLife.00184. Epub 2012 Dec 13 2. Dong W, Lu W,McKeehan WL, Luo Y,Ye S*,(2012).Structural Basis of Heparan Sulfate-Specific Degradation by Heparinase III.Protein Cell,3:950-61 3.Ye S*, Li Y, Jiang Y.(2010).Novel insights into ion selectivity from high resolution structures of an open Kchannel pore.Nat Struct Mol Biol,17:1019-23. 4. Wu Y, Yang, Y,Ye S, Jiang Y. (2010).Structure of the Gating Ring from the Human High-conductance Ca2+-gated K+ Channel.Nature,466:393-7. 5.Ye S, Li Y, Chen L, Jiang Y.(2006).Crystal structures of a Ligand-free MthK gating ring: Insights into the ligand gating mechanism of Kchannel.Cell,126:1161-73. 6. Shi N,Ye S, Alam A, Chen L, Jiang Y.(2006).Atomic Structure of a Naand KConducting Channel.Nature440:570-574. 7.Ye S, Cech AL, Belmares R, Bergstrom RC, Tong Y, Corey DR, Kanost MR, and Goldsmith EJ.(2001).The structure of a Michaelis Serpin-Protease Complex.Nat Struct Biol,8:979-983 8.Ying Li, Jen Hsin, Lingyun Zhao, Yiwen Cheng, Weina Shang, Kerwyn Casey Huang, Hong-Wei Wang, Sheng Ye.(2013).FtsZ Protofilaments Use a Hinge-Opening Mechanism for Constrictive Force Generation.Science,341:392-395.